2020年10月20日，Nucleic Acids Research在线发表了中国烟草总公司郑州烟草研究院国家烟草基因研究中心曹培健为通讯作者题为“PLncDB V2.0: a comprehensive encyclopedia of plant long noncoding RNAs”的研究论文。

长链非编码RNA（lncRNA）是长度大于200个核苷酸且基本无蛋白质编码能力的转录本。随着lncRNA数目不断扩大，以及其在植物中功能研究不断积累，因此有必要为lncRNA研究建立一个全面的数据库。然而，当前可用的植物lncRNA数据库存在一些不足之处，包括缺乏某些模式植物的lncRNA数据、注释标准不一、缺乏表达模式的可视化以及表观遗传信息。为了解决这些问题，研究人员升级了基于统一注释pipeline的植物长链非编码RNA数据库（PLncDB，http://plncdb.tobaccodb.org/）。PLncDB V2.0当前包含基于13834个RNA-Seq数据集的80种植物的1246372个lncRNA，整合了来自其他四个资源的lncRNA信息，包括EVLncRNAs、RNAcentral等。表达模式和表观遗传信号可以使用多种工具（JBrowse、eFP Browser和EPexplorer）进行可视化。该数据库还提供了lncRNA的靶标和调控网络以用于功能研究。此外，PLncDB V2.0是分级且用户友好的，具有五个内置搜索引擎。

PLncDB V2.0有利于植物lncRNA研究，为植物中数据驱动的lncRNA研究提供了较为全面的资源。

原文链接：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkaa910/5932847

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